El clima de Indonesia es casi totalmente tropical en las islas orientales y ecuatorial en las islas del oeste. Las aguas cálidas constituyen el 81% de la superficie de Indonesia y garantizan que las temperaturas en la tierra se mantengan relativamente constantes, con las llanuras costeras a un promedio de 28 ° C, en el interior y las zonas de montaña una media de 26 ° C, y las regiones montañosas más altas, 23 ° C. La temperatura varía poco de una temporada a otra.Indonesia experimenta relativamente pocos cambios en la duración de las horas del día de una temporada a otra, la diferencia entre el día más largo y el día más corto del año es sólo cuarenta y ocho minutos.
La variable principal del clima de Indonesia no es la temperatura o la presión del aire, pero las precipitaciones. Humedad relativa de la zona oscila entre el 70 y el 90%.

Los vientos son moderados y predecibles en general, los monzones soplan desde el sur y el este de junio a septiembre y desde el noroeste de diciembre a marzo. Los tifones y tormentas a gran escala presentan un riesgo menor para los marinos en las aguas de Indonesia, el mayor peligro proviene de corrientes rápidas en los canales, como la de Lombok y Sape estrechos.

Los Monzones

Las variaciones extremas en las lluvias están relacionadas con los monzones. En términos generales, existe una estación seca de junio a octubre, influenciada por las masas de aire continental de Australia, y una temporada de lluvias que va de noviembre a marzo, que es el resultado de la interacción de las masas de aire de Asia y el Océano Pacífico. Los patrones locales de viento, sin embargo, en gran medida puede modificar las pautas de vientos en general, especialmente en las islas Maluku, en el centro de Seram, Ambon, y Buru. Este patrón de oscilación anual del viento y la lluvia está relacionada con la ubicación geográfica de Indonesia como un istmo entre dos grandes continentes. En septiembre y mayo la alta presión sobre el desierto de Gobi mueve vientos de ese continente hacia el noroeste. Como los vientos alcanzan el ecuador, la rotación de la Tierra hace que se desvíe de su curso original en dirección noreste hacia el continente del sudeste asiático. Durante enero y febrero, un sistema de baja presión que corresponde a Asia hace que el patrón se invierta. El resultado es un monzón que se ve aumentado por las brisas húmedas del Océano Índico, produciendo cantidades significativas de lluvia en muchas partes del archipiélago.

Los vientos y lluvia.

Los patrones de viento predominante interactuar con las condiciones topográficas, para producir variaciones significativas en las precipitaciones en todo el archipiélago. En general, las partes oeste y el norte de Indonesia, experimenta la mayoría de las precipitaciones, ya que las nubes del monzón del norte que van hacia el oeste en movimiento están cargadas de humedad en el momento en que lleguan a las regiones más distantes. Oeste de Sumatra, Java, Bali, el interior de Kalimantan, Sulawesi y Papua son las regiones más húmedas de Indonesia, con una precipitación de más de 2.000 milímetros (78,7 pulgadas) por año. En parte, esta humedad se origina en los picos de alta montaña que atrapan el aire húmedo. La ciudad de Bogor , cerca de Yakarta, reclama tener el mayor número de tormentas de lluvia al año 322. Por otro lado, las islas más cercanas a Australia, incluyendo Nusa Tenggara y el extremo oriental de Java, tienden a ser secas, con algunas zonas con menos de 1.000 milímetros (39,4 pulgadas) por año. Para complicar la situación, algunas de las islas de las Molucas del sur sufren unos patrones de lluvia muy impredecibles, dependiendo de las corrientes de aire local.

La temperatura.

Las variaciones de temperatura no son especialmente reseñables ya que no acusan cambios extremos entre estaciones a nivel de mar. En general, las temperaturas descienden alrededor de 1 ° por 90 metros de incremento en la elevación del nivel del mar, con algunas regiones montañosas de gran altura interior que experimentan heladas nocturnas. Las cordilleras más altas de Papúa están permanentemente cubiertos de nieve.